Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms