Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms