Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms