Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
BLNKQ8WV28 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BLNKQ8WV28 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms