Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms