Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms