Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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