Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms