Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms