Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms