Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBLN3Q6UW01 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms