Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms