Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms