Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms