Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms