Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms