Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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