Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CA9Q16790 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CA9Q16790 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms