Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.8 ms