Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
USF2Q15853 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
USF2Q15853 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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