Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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