Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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CDK5R1Q15078 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDK5R1Q15078 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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