Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IKBKEQ14164 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IKBKEQ14164 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms