Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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NAE1Q13564 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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NAE1Q13564 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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NAE1Q13564 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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NAE1Q13564 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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NAE1Q13564 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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NAE1Q13564 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NAE1Q13564 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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