Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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