Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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