Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM32Q13049 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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