Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms