Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms