Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms