Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms