Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms