Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms