Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP7AQ04656 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms