Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms