Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms