Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms