Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms