Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.7 ms