Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSCP56915 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSCP56915 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSCP56915 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms