Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BACE1P56817 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BACE1P56817 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms