Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms