Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOSBP53539 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOSBP53539 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms