Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms