Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATMP50440 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms