Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms