Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms