Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms