Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms