Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GJC1P36383 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms